この間、ニューヨーク大学スターン経営大学院で1年間、カリフォルニア大学バークレー校ハース経営大学院に2年間、客員研究員として研究を行う。
また、2009年から2011年まで経営哲学学会会長を務め、現在、日本経営学会理事、経営行動研究学会理事、経営哲学学会理事。

専門は新制度派経済学（組織の経済学）であり、なぜ組織は合理的に失敗するのか、そして、この不条理からどのようにして抜けだせるのかを研究テーマとし、旧日本軍の事例などを用いて、理論的な解決法や哲学的な解決法について研究している。

『日米独組織の経済分析』文眞堂、1998年

『組織の不条理』ダイヤモンド社、2000年（2017年・中公文庫）

『比較コーポレート・ガバナンス論』有斐閣、2004年　※第１回経営学史学会賞受賞

『＜業界分析＞組織の経済学－新制度派経済学の応用』（共著）、中央経済社、2006年

『組織の経済学入門－新制度派経済学』有斐閣、2006年（2016年・改訂版）

『「命令違反」が組織を伸ばす』光文社（光文社新書）、2007年

『なぜ上司とは、かくも理不尽なものなのか』扶桑社（扶桑社新書）、2007年

『戦略学―立体的戦略の原理』ダイヤモンド社、2008年

『組織は合理的に失敗する』日経新聞社（日経ビジネス人文庫）、2009年

『戦略の不条理―なぜ合理的な行動は失敗するのか』光文社（光文社新書）、2009年

『企業の不条理―「合理的失敗」はなぜ起こるのか』（共著）、中央経済社、2010年

『なぜ改革は合理的に失敗するのか―改革の不条理』朝日新聞出版、2011年

『失敗の本質―戦場のリーダーシップ篇』（共著）、ダイヤモンド社、2012年

『日本と日本軍の失敗のメカニズム 事例研究』（共著）、中央公論新社、2013年

『ビジネススクールでは教えてくれないドラッカー』祥伝社（祥伝社新書）、2015年※慶應義塾賞受賞

『組織の不条理―日本軍の失敗に学ぶ』中央公論社（中公文庫）2017年

その他多数。

『失敗の本質―リーダーシップ篇』野中郁次郎編著、ダイヤモンド社、2014年